Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AQP4P55087 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AQP4P55087 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
AQP4P55087 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AQP4P55087 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
AQP4P55087 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AQP4P55087 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AQP4P55087 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AQP4P55087 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AQP4P55087 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AQP4P55087 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
AQP4P55087 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AQP4P55087 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AQP4P55087 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AQP4P55087 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AQP4P55087 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AQP4P55087 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AQP4P55087 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AQP4P55087 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AQP4P55087 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AQP4P55087 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AQP4P55087 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AQP4P55087 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AQP4P55087 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AQP4P55087 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
AQP4P55087 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AQP4P55087 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AQP4P55087 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AQP4P55087 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AQP4P55087 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AQP4P55087 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AQP4P55087 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AQP4P55087 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AQP4P55087 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AQP4P55087 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AQP4P55087 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AQP4P55087 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AQP4P55087 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AQP4P55087 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AQP4P55087 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AQP4P55087 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AQP4P55087 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AQP4P55087 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
AQP4P55087 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AQP4P55087 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AQP4P55087 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AQP4P55087 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AQP4P55087 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AQP4P55087 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
AQP4P55087 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AQP4P55087 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AQP4P55087 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AQP4P55087 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AQP4P55087 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AQP4P55087 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AQP4P55087 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AQP4P55087 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
AQP4P55087 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AQP4P55087 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AQP4P55087 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AQP4P55087 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AQP4P55087 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AQP4P55087 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AQP4P55087 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AQP4P55087 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AQP4P55087 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AQP4P55087 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AQP4P55087 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AQP4P55087 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AQP4P55087 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AQP4P55087 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AQP4P55087 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AQP4P55087 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AQP4P55087 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AQP4P55087 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AQP4P55087 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AQP4P55087 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AQP4P55087 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AQP4P55087 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
AQP4P55087 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AQP4P55087 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AQP4P55087 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
AQP4P55087 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AQP4P55087 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
AQP4P55087 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AQP4P55087 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AQP4P55087 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AQP4P55087 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AQP4P55087 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AQP4P55087 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AQP4P55087 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AQP4P55087 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AQP4P55087 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AQP4P55087 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AQP4P55087 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AQP4P55087 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AQP4P55087 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AQP4P55087 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AQP4P55087 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AQP4P55087 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms