Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms