Protein–RNA interactions for Protein: P52747

ZNF143, Zinc finger protein 143, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF143P52747 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF143P52747 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms