Protein–RNA interactions for Protein: P49458

SRP9, Signal recognition particle 9 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP9P49458 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRP9P49458 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRP9P49458 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRP9P49458 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRP9P49458 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRP9P49458 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRP9P49458 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRP9P49458 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SRP9P49458 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRP9P49458 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRP9P49458 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRP9P49458 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRP9P49458 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRP9P49458 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRP9P49458 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SRP9P49458 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRP9P49458 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRP9P49458 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRP9P49458 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SRP9P49458 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRP9P49458 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRP9P49458 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRP9P49458 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRP9P49458 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRP9P49458 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRP9P49458 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRP9P49458 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRP9P49458 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRP9P49458 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRP9P49458 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRP9P49458 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRP9P49458 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRP9P49458 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRP9P49458 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRP9P49458 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRP9P49458 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRP9P49458 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRP9P49458 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRP9P49458 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRP9P49458 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRP9P49458 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRP9P49458 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRP9P49458 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRP9P49458 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRP9P49458 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SRP9P49458 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRP9P49458 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRP9P49458 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRP9P49458 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SRP9P49458 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRP9P49458 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SRP9P49458 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRP9P49458 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRP9P49458 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRP9P49458 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRP9P49458 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SRP9P49458 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRP9P49458 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRP9P49458 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRP9P49458 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRP9P49458 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRP9P49458 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRP9P49458 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRP9P49458 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRP9P49458 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRP9P49458 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRP9P49458 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRP9P49458 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRP9P49458 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRP9P49458 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRP9P49458 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRP9P49458 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRP9P49458 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRP9P49458 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SRP9P49458 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRP9P49458 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRP9P49458 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRP9P49458 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SRP9P49458 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRP9P49458 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRP9P49458 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRP9P49458 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRP9P49458 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRP9P49458 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRP9P49458 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRP9P49458 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRP9P49458 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRP9P49458 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SRP9P49458 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRP9P49458 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRP9P49458 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRP9P49458 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRP9P49458 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRP9P49458 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRP9P49458 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRP9P49458 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SRP9P49458 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRP9P49458 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRP9P49458 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRP9P49458 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms