Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms