Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms