Protein–RNA interactions for Protein: P36871

PGM1, Phosphoglucomutase-1, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM1P36871 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGM1P36871 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGM1P36871 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGM1P36871 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGM1P36871 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGM1P36871 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGM1P36871 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGM1P36871 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGM1P36871 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGM1P36871 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGM1P36871 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGM1P36871 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGM1P36871 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PGM1P36871 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGM1P36871 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGM1P36871 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGM1P36871 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGM1P36871 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGM1P36871 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PGM1P36871 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGM1P36871 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGM1P36871 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGM1P36871 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGM1P36871 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGM1P36871 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGM1P36871 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGM1P36871 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGM1P36871 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PGM1P36871 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGM1P36871 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGM1P36871 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGM1P36871 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGM1P36871 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGM1P36871 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGM1P36871 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGM1P36871 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGM1P36871 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGM1P36871 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGM1P36871 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGM1P36871 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGM1P36871 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGM1P36871 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGM1P36871 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PGM1P36871 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PGM1P36871 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGM1P36871 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGM1P36871 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGM1P36871 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGM1P36871 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGM1P36871 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGM1P36871 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGM1P36871 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGM1P36871 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGM1P36871 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGM1P36871 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGM1P36871 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGM1P36871 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGM1P36871 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGM1P36871 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGM1P36871 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGM1P36871 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGM1P36871 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGM1P36871 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGM1P36871 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGM1P36871 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGM1P36871 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGM1P36871 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGM1P36871 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGM1P36871 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGM1P36871 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGM1P36871 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGM1P36871 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PGM1P36871 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PGM1P36871 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PGM1P36871 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PGM1P36871 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PGM1P36871 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PGM1P36871 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PGM1P36871 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PGM1P36871 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PGM1P36871 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PGM1P36871 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PGM1P36871 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PGM1P36871 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PGM1P36871 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PGM1P36871 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PGM1P36871 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGM1P36871 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGM1P36871 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGM1P36871 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGM1P36871 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGM1P36871 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGM1P36871 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PGM1P36871 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGM1P36871 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGM1P36871 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGM1P36871 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGM1P36871 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGM1P36871 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGM1P36871 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms