Protein–RNA interactions for Protein: P35670

ATP7B, Copper-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7BP35670 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP7BP35670 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP7BP35670 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP7BP35670 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP7BP35670 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP7BP35670 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP7BP35670 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP7BP35670 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP7BP35670 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP7BP35670 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP7BP35670 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP7BP35670 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP7BP35670 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP7BP35670 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP7BP35670 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP7BP35670 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP7BP35670 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP7BP35670 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP7BP35670 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP7BP35670 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP7BP35670 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP7BP35670 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP7BP35670 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP7BP35670 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms