Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms