Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
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CASQ1P31415 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
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CASQ1P31415 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
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