Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSFA2P28290 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms