Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms