Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSSP25774 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSSP25774 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSSP25774 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSSP25774 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSSP25774 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTSSP25774 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTSSP25774 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTSSP25774 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTSSP25774 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTSSP25774 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTSSP25774 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTSSP25774 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTSSP25774 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTSSP25774 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTSSP25774 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CTSSP25774 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTSSP25774 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTSSP25774 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CTSSP25774 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTSSP25774 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTSSP25774 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTSSP25774 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTSSP25774 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTSSP25774 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CTSSP25774 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTSSP25774 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTSSP25774 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTSSP25774 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTSSP25774 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTSSP25774 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTSSP25774 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTSSP25774 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTSSP25774 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTSSP25774 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTSSP25774 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTSSP25774 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTSSP25774 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTSSP25774 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTSSP25774 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTSSP25774 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTSSP25774 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTSSP25774 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTSSP25774 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTSSP25774 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTSSP25774 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTSSP25774 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTSSP25774 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTSSP25774 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTSSP25774 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTSSP25774 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTSSP25774 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTSSP25774 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTSSP25774 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTSSP25774 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTSSP25774 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTSSP25774 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTSSP25774 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTSSP25774 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTSSP25774 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTSSP25774 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTSSP25774 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTSSP25774 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTSSP25774 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTSSP25774 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTSSP25774 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTSSP25774 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTSSP25774 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTSSP25774 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTSSP25774 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTSSP25774 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTSSP25774 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTSSP25774 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTSSP25774 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTSSP25774 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTSSP25774 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CTSSP25774 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CTSSP25774 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CTSSP25774 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTSSP25774 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTSSP25774 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTSSP25774 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CTSSP25774 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTSSP25774 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTSSP25774 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTSSP25774 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSSP25774 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSSP25774 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSSP25774 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSSP25774 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSSP25774 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSSP25774 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSSP25774 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSSP25774 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSSP25774 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSSP25774 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSSP25774 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSSP25774 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSSP25774 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSSP25774 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms