Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAMP1P23763 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms