Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA1P20827 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms