Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATF3P18847 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATF3P18847 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATF3P18847 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATF3P18847 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATF3P18847 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATF3P18847 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATF3P18847 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATF3P18847 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATF3P18847 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATF3P18847 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATF3P18847 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATF3P18847 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATF3P18847 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATF3P18847 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATF3P18847 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATF3P18847 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATF3P18847 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ATF3P18847 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATF3P18847 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATF3P18847 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATF3P18847 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATF3P18847 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ATF3P18847 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATF3P18847 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATF3P18847 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATF3P18847 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATF3P18847 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATF3P18847 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATF3P18847 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATF3P18847 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ATF3P18847 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF3P18847 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF3P18847 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF3P18847 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF3P18847 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF3P18847 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF3P18847 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF3P18847 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF3P18847 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF3P18847 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF3P18847 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF3P18847 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF3P18847 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF3P18847 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF3P18847 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF3P18847 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF3P18847 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF3P18847 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF3P18847 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF3P18847 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF3P18847 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF3P18847 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF3P18847 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF3P18847 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF3P18847 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF3P18847 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATF3P18847 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATF3P18847 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATF3P18847 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATF3P18847 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATF3P18847 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATF3P18847 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATF3P18847 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ATF3P18847 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATF3P18847 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ATF3P18847 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATF3P18847 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ATF3P18847 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATF3P18847 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATF3P18847 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATF3P18847 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ATF3P18847 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATF3P18847 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ATF3P18847 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATF3P18847 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATF3P18847 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATF3P18847 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATF3P18847 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATF3P18847 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATF3P18847 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATF3P18847 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATF3P18847 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATF3P18847 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATF3P18847 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ATF3P18847 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATF3P18847 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ATF3P18847 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ATF3P18847 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATF3P18847 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ATF3P18847 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATF3P18847 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATF3P18847 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATF3P18847 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATF3P18847 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATF3P18847 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATF3P18847 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATF3P18847 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATF3P18847 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATF3P18847 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms