Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOP08100 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOP08100 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOP08100 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOP08100 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOP08100 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOP08100 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOP08100 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOP08100 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOP08100 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOP08100 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOP08100 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOP08100 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOP08100 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOP08100 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOP08100 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOP08100 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOP08100 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOP08100 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOP08100 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOP08100 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOP08100 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOP08100 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOP08100 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOP08100 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOP08100 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOP08100 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOP08100 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOP08100 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOP08100 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOP08100 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOP08100 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOP08100 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOP08100 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOP08100 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOP08100 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOP08100 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOP08100 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOP08100 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOP08100 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOP08100 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOP08100 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOP08100 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOP08100 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOP08100 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOP08100 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOP08100 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOP08100 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOP08100 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOP08100 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOP08100 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOP08100 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOP08100 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOP08100 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOP08100 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOP08100 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOP08100 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOP08100 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOP08100 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOP08100 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOP08100 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOP08100 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOP08100 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOP08100 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOP08100 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOP08100 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOP08100 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOP08100 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOP08100 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOP08100 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOP08100 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOP08100 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOP08100 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOP08100 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOP08100 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOP08100 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOP08100 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOP08100 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOP08100 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOP08100 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOP08100 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOP08100 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOP08100 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOP08100 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOP08100 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOP08100 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOP08100 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOP08100 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOP08100 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOP08100 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOP08100 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOP08100 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOP08100 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOP08100 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOP08100 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOP08100 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOP08100 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOP08100 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOP08100 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOP08100 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms