Protein–RNA interactions for Protein: P05160

F13B, Coagulation factor XIII B chain, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13BP05160 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
F13BP05160 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
F13BP05160 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
F13BP05160 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F13BP05160 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
F13BP05160 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F13BP05160 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
F13BP05160 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
F13BP05160 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
F13BP05160 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F13BP05160 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
F13BP05160 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
F13BP05160 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
F13BP05160 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
F13BP05160 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
F13BP05160 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F13BP05160 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
F13BP05160 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F13BP05160 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F13BP05160 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
F13BP05160 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F13BP05160 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
F13BP05160 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F13BP05160 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F13BP05160 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
F13BP05160 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F13BP05160 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F13BP05160 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F13BP05160 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F13BP05160 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
F13BP05160 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F13BP05160 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
F13BP05160 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F13BP05160 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
F13BP05160 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F13BP05160 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
F13BP05160 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
F13BP05160 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
F13BP05160 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
F13BP05160 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
F13BP05160 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
F13BP05160 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
F13BP05160 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F13BP05160 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F13BP05160 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F13BP05160 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
F13BP05160 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
F13BP05160 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
F13BP05160 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
F13BP05160 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
F13BP05160 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
F13BP05160 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
F13BP05160 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
F13BP05160 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
F13BP05160 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
F13BP05160 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
F13BP05160 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
F13BP05160 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
F13BP05160 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
F13BP05160 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
F13BP05160 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
F13BP05160 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
F13BP05160 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
F13BP05160 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
F13BP05160 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
F13BP05160 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
F13BP05160 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
F13BP05160 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
F13BP05160 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
F13BP05160 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
F13BP05160 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
F13BP05160 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
F13BP05160 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
F13BP05160 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
F13BP05160 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
F13BP05160 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
F13BP05160 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
F13BP05160 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
F13BP05160 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
F13BP05160 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
F13BP05160 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
F13BP05160 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
F13BP05160 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
F13BP05160 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
F13BP05160 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
F13BP05160 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
F13BP05160 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
F13BP05160 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
F13BP05160 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
F13BP05160 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
F13BP05160 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
F13BP05160 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
F13BP05160 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
F13BP05160 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
F13BP05160 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
F13BP05160 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
F13BP05160 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
F13BP05160 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
F13BP05160 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
F13BP05160 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms