Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAPBO95292 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAPBO95292 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAPBO95292 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAPBO95292 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAPBO95292 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAPBO95292 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAPBO95292 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAPBO95292 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAPBO95292 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAPBO95292 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAPBO95292 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAPBO95292 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAPBO95292 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAPBO95292 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAPBO95292 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAPBO95292 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
VAPBO95292 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAPBO95292 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAPBO95292 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAPBO95292 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAPBO95292 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAPBO95292 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAPBO95292 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAPBO95292 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAPBO95292 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAPBO95292 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAPBO95292 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAPBO95292 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAPBO95292 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAPBO95292 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAPBO95292 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAPBO95292 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAPBO95292 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAPBO95292 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAPBO95292 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAPBO95292 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAPBO95292 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAPBO95292 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAPBO95292 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAPBO95292 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAPBO95292 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAPBO95292 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
VAPBO95292 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAPBO95292 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAPBO95292 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAPBO95292 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAPBO95292 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAPBO95292 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAPBO95292 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAPBO95292 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
VAPBO95292 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAPBO95292 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAPBO95292 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAPBO95292 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAPBO95292 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAPBO95292 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAPBO95292 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAPBO95292 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAPBO95292 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAPBO95292 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAPBO95292 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPBO95292 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPBO95292 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPBO95292 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPBO95292 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPBO95292 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPBO95292 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPBO95292 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPBO95292 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPBO95292 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPBO95292 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPBO95292 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPBO95292 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPBO95292 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPBO95292 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPBO95292 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPBO95292 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPBO95292 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPBO95292 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPBO95292 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPBO95292 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPBO95292 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPBO95292 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPBO95292 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPBO95292 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPBO95292 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPBO95292 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPBO95292 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPBO95292 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPBO95292 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPBO95292 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPBO95292 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPBO95292 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPBO95292 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPBO95292 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAPBO95292 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAPBO95292 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAPBO95292 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAPBO95292 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms