Protein–RNA interactions for Protein: O94972

TRIM37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM37O94972 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM37O94972 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM37O94972 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM37O94972 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM37O94972 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM37O94972 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM37O94972 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM37O94972 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM37O94972 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM37O94972 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM37O94972 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM37O94972 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM37O94972 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM37O94972 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM37O94972 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM37O94972 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM37O94972 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM37O94972 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM37O94972 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM37O94972 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM37O94972 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM37O94972 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM37O94972 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM37O94972 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM37O94972 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM37O94972 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM37O94972 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM37O94972 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM37O94972 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM37O94972 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM37O94972 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM37O94972 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM37O94972 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM37O94972 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM37O94972 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM37O94972 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM37O94972 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM37O94972 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM37O94972 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM37O94972 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM37O94972 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM37O94972 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM37O94972 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM37O94972 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM37O94972 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM37O94972 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM37O94972 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM37O94972 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM37O94972 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM37O94972 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM37O94972 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM37O94972 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM37O94972 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM37O94972 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM37O94972 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM37O94972 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM37O94972 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM37O94972 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM37O94972 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM37O94972 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM37O94972 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM37O94972 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM37O94972 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM37O94972 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM37O94972 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM37O94972 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM37O94972 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM37O94972 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM37O94972 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM37O94972 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM37O94972 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM37O94972 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM37O94972 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM37O94972 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM37O94972 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM37O94972 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM37O94972 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM37O94972 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM37O94972 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM37O94972 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM37O94972 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM37O94972 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM37O94972 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM37O94972 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM37O94972 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM37O94972 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM37O94972 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM37O94972 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM37O94972 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM37O94972 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM37O94972 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM37O94972 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM37O94972 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM37O94972 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM37O94972 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM37O94972 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM37O94972 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM37O94972 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM37O94972 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM37O94972 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms