Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA2O43921 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms