Protein–RNA interactions for Protein: O15198

SMAD9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD9O15198 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMAD9O15198 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD9O15198 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD9O15198 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD9O15198 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD9O15198 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD9O15198 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD9O15198 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD9O15198 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD9O15198 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD9O15198 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD9O15198 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD9O15198 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD9O15198 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD9O15198 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD9O15198 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD9O15198 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD9O15198 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD9O15198 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD9O15198 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD9O15198 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD9O15198 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD9O15198 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD9O15198 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD9O15198 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD9O15198 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms