Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASKO14936 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASKO14936 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASKO14936 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASKO14936 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASKO14936 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASKO14936 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASKO14936 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASKO14936 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASKO14936 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASKO14936 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASKO14936 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASKO14936 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CASKO14936 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASKO14936 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASKO14936 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASKO14936 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CASKO14936 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASKO14936 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASKO14936 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASKO14936 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASKO14936 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CASKO14936 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASKO14936 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASKO14936 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASKO14936 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASKO14936 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASKO14936 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASKO14936 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASKO14936 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASKO14936 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASKO14936 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASKO14936 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASKO14936 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASKO14936 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASKO14936 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASKO14936 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CASKO14936 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASKO14936 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASKO14936 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASKO14936 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASKO14936 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASKO14936 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASKO14936 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASKO14936 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASKO14936 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASKO14936 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASKO14936 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASKO14936 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASKO14936 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASKO14936 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASKO14936 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASKO14936 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASKO14936 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASKO14936 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASKO14936 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASKO14936 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASKO14936 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASKO14936 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASKO14936 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASKO14936 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASKO14936 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASKO14936 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASKO14936 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CASKO14936 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASKO14936 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASKO14936 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASKO14936 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASKO14936 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASKO14936 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASKO14936 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASKO14936 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASKO14936 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASKO14936 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASKO14936 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CASKO14936 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASKO14936 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASKO14936 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASKO14936 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASKO14936 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASKO14936 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASKO14936 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CASKO14936 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CASKO14936 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CASKO14936 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CASKO14936 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CASKO14936 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CASKO14936 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CASKO14936 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CASKO14936 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASKO14936 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASKO14936 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASKO14936 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASKO14936 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASKO14936 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CASKO14936 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASKO14936 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASKO14936 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASKO14936 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CASKO14936 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms