Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms