Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF316A6NFI3 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms