Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms