Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POMPQ9Y244 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms