Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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