Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TNIKQ9UKE5 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TNIKQ9UKE5 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TNIKQ9UKE5 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TNIKQ9UKE5 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TNIKQ9UKE5 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TNIKQ9UKE5 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms