Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN11AQ9UI33 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms