Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms