Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms