Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MIS18AQ9NYP9 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms