Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COMMD8Q9NX08 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms