Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG3Q9NT62 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms