Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms