Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPJQ9HC77 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms