Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPR88Q9GZN0 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms