Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PMCHL2Q9BQD1 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms