Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQB6

VKORC1, Vitamin K epoxide reductase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VKORC1Q9BQB6 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VKORC1Q9BQB6 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms