Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
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SPOCK3Q9BQ16 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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SPOCK3Q9BQ16 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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SPOCK3Q9BQ16 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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