Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms