Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms