Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSNARE1Q96NA8 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms