Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC17Q96LX7 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC17Q96LX7 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC17Q96LX7 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC17Q96LX7 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms