Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY3

LIN37, Protein lin-37 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN37Q96GY3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LIN37Q96GY3 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms