Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LTV1Q96GA3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LTV1Q96GA3 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LTV1Q96GA3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LTV1Q96GA3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LTV1Q96GA3 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LTV1Q96GA3 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LTV1Q96GA3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LTV1Q96GA3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LTV1Q96GA3 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LTV1Q96GA3 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LTV1Q96GA3 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LTV1Q96GA3 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LTV1Q96GA3 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LTV1Q96GA3 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LTV1Q96GA3 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LTV1Q96GA3 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LTV1Q96GA3 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LTV1Q96GA3 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LTV1Q96GA3 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LTV1Q96GA3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LTV1Q96GA3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LTV1Q96GA3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LTV1Q96GA3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LTV1Q96GA3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LTV1Q96GA3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LTV1Q96GA3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LTV1Q96GA3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTV1Q96GA3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTV1Q96GA3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTV1Q96GA3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTV1Q96GA3 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTV1Q96GA3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTV1Q96GA3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTV1Q96GA3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms