Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGF29Q96ES7 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms