Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms