Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAF2Q96CS3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms